审计单位与业主一般是按结算造价的比例支付审计费用，这个系数根据项目不同系数也不同，可以是2%或3%。另外超出审核造价后5%部分按5%的审计费由施工方支付。
不管哪一级的审计局设计，都不准收取审计费，而事务所审计的审计费用由谁出，按甲、乙双方协商，如果没有协商，那就是谁主张，谁负责费用。
如果工程结算审计是由中介机构完成的话，审计费由建设单位支付。
如果工程结算审计由国家审计机关审计的话，不需要支付审计费。
由合同总承包单位承担工程竣工决算审计费用。
扩展资料：
中国采用的工程结算方式主要有以下几种：
(1)按月结算
实行旬末或月中预支，月终结算，竣工后清算的方法。跨年度竣工的工程，在年终进行工程盘点，办理年度结算。
(2)竣工后一次结算
建设项目或单项工程全部建筑安装工程建设期在12个月以内，或者工程承包价值在100万元以下的，可以实行工程价款每月月中预支，竣工后一次结算。
(3)分段结算
即当年开工，当年不能竣工的单项工程或单位工程按照工程形象进度，划分不同阶段进行结算。
(4)目标结算方式
即在工程合同中，将承包工程的内容分解成不同的控制界面，以业主验收控制界面作为支付工程款的前提条件。也就是说，将合同中的工程内容分解成不同的验收单元，当施工单位完成单元工程内容并经业主经验收后，业主支付构成单元工程内容的工程价款。
在目标结算方式下，施工单位要想获得工程价款，必须按照合同约定的质量标准完成界面内的工程内容，要想尽早获得工程价款，施工单位必须充分发挥自己的组织实施能力，在保证质量的前提下，加快施工进度。
(5)结算双方约定的其他结算方式
实行预收备料款的工程项目，在承包合同或协议中应明确发包单位(甲方)在开工前拨付给承包单位(乙方)工程备料款的预付数额、预付时间，开工后扣还备料款的起扣点、逐次扣还的比例，以及办理的手续和方法。
按照中国有关规定，备料款的预付时间应不迟于约定的开工日期前7天。发包方不按约定预付的，承包方在约定预付时间7天后发包方发出要求预付的通知。
发包方收到通知后仍不能按要求预付，承包方可在发出通知后7天停止施工，发包方应从约定应付之日起向承包方支付应付款的贷款利息，并承担违约责任。
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