增值税网上申报时显示申报数据比对不通过有如下几个方面造成的：
根据税法规定的增值税一般纳税人申报表填写次序为：固定资产进项税额抵扣情况表(必填);附表一(必填);附表三(改征增值税纳税人必填，其他纳税人不需填写);四小票(非必填);稽核数据结果清单确认(辅导期纳税人必填，其他纳税人不需填写);附表二(必填);主表(必填)。成品油购销存情况明细表(非必填)。
如纳税人发现系统带出的企业的基本信息、认证信息与实际数不一致，申报数据比对也会不通过。解决方法是：可点击“更新基础资料”，系统将重新从征管系统和防伪税控稽核等系统提取数据。点击“更新”之后，退出申报模块，过五分钟后重新进入即可。
如纳税人在进行网上申报时，由于销项税额汇总数四舍五入的原因，显示申报数据比对不通过，也会造成附表一销项(应纳)税额与企业抄报税销项税额存在误差。解决方法是：误差范围在1元以内的，根据总局有关文件精神，允许纳税人正常申报。对由于四舍五入问题产生的误差与实际的数据不符的问题，纳税人可以通过调整申报表附表一的1至8列对应销项(应纳)税额解决。
如由于14栏数据将直接写入主表，为确保数据准确性，9至14栏由系统自动计算，不能手工修改，也会造成申报时显示申报数据比对不通过。解决方法是由此产生的误差将不会影响纳税人的一窗式比对和清卡。可以到当地税务大厅申报则可以修改9至14栏。
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