根据《关于调整增值税扣税凭证抵扣期限有关问题的通知》：
第三条、增值税一般纳税人取得2010年1月1日以后开具的增值税专用发票、公路内河货物运输业统一发票、机动车销售统一发票以及海关缴款书，未在规定期限内到税务机关办理认证、申报抵扣或者申请稽核比对的，不得作为合法的增值税扣税凭证，不得计算进项税额抵扣。
根据《关于调整增值税扣税凭证抵扣期限有关问题的通知》：
第一条、增值税一般纳税人取得2010年1月1日以后开具的增值税专用发票、公路内河货物运输业统一发票和机动车销售统一发票，应在开具之日起180日内到税务机关办理认证，并在认证通过的次月申报期内，向主管税务机关申报抵扣进项税额。
第二条、实行海关进口增值税专用缴款书(以下简称海关缴款书)“先比对后抵扣”管理办法的增值税一般纳税人取得2010年1月1日以后开具的海关缴款书，应在开具之日起180日内向主管税务机关报送《海关完税凭证抵扣清单》(包括纸质资料和电子数据)申请稽核比对。
未实行海关缴款书“先比对后抵扣”管理办法的增值税一般纳税人取得2010年1月1日以后开具的海关缴款书，应在开具之日起180日后的第一个纳税申报期结束以前，向主管税务机关申报抵扣进项税额。
参考资料来源：国家税务总局-关于调整增值税扣税凭证抵扣期限有关问题的通知
根据《国家税务总局关于全面推行增值税发票系统升级版有关问题的公告》(国家税务总局公告2015年第19号)规定，增值税专用发票尚未交付购买方或者购买方拒收的，销售方应于专用发票认证期限内在增值税发票系统升级版中填开并上传《信息表》。因此，除了属于《国家税务总局关于逾期增值税扣税凭证抵扣问题的公告》(国家税务总局公告2011年第50号)第二条的客观原因以外，超过认证期没有认证的增值税专用发票，不可以申请开具红字增值税专用发票。 客观原因包括如下类型：
(一)因自然灾害、社会突发事件等不可抗力因素造成增值税扣税凭证逾期;
(二)增值税扣税凭证被盗、抢，或者因邮寄丢失、误递导致逾期;
(三)有关司法、行政机关在办理业务或者检查中，扣押增值税扣税凭证，纳税人不能正常履行申报义务，或者税务机关信息系统、网络故障，未能及时处理纳税人网上认证数据等导致增值税扣税凭证逾期;
(四)买卖双方因经济纠纷，未能及时传递增值税扣税凭证，或者纳税人变更纳税地点，注销旧户和重新办理税务登记的时间过长，导致增值税扣税凭证逾期;
(五)由于企业办税人员伤亡、突发危重疾病或者擅自离职，未能办理交接手续，导致增值税扣税凭证逾期;
(六)国家税务总局规定的其他情形。
答:我们先看看在2016年7月31日之前的规定，当时开具红字增值税专用发票的文件是《关于全面推行增值税发票系统升级版有关问题的公告》(国家税务总局公告2015年第19号)第五条第一款规定，一般纳税人开具增值税专用发票或货物运输业增值税专用发票(以下统称专用发票)后，发生销货退回、开票有误、应税服务中止以及发票抵扣联、发票联均无法认证等情形但不符合作废条件，或者因销货部分退回及发生销售折让，需要开具红字专用发票的，暂按以下方法处理。关键是，这一款下面还有一句话:专用发票尚未交付购买方或者购买方拒收的，销售方应于专用发票认证期限内在增值税发票系统升级版中填开并上传《信息表》。
因此，在2016年7月31日前，文件是明确规定，超过认证期限的专用发票，是不得填开信息表进行冲红处理的。
但是在2016年8月1日以后，总局又下发了一个新的文件，《国家税务总局关于红字增值税发票开具有关问题的公告》(国家税务总局公告2016年第47号 )第一条规定，增值税一般纳税人开具增值税专用发票后，发生销货退回、开票有误、应税服务中止等情形但不符合发票作废条件，或者因销货部分退回及发生销售折让，需要开具红字专用发票的，按以下方法处理:
销售方开具专用发票尚未交付购买方，以及购买方未用于申报抵扣并将发票联及抵扣联退回的，销售方可在新系统中填开并上传《信息表》。销售方填开《信息表》时应填写相对应的蓝字专用发票信息。
分析上述规定，尚未交付购买方的增值税专用发票需要开具红字发票，必须在“认证期限内”上传《信息表》的规定已经作废。2016年47号公告中并没有规定必须在“认证期内”，从文件上说超过认证期限未认证的发票也可以开具红字发票了，虽然可以从增值税发票管理新系统中开出，但是超期未认证抵扣，开具红票后重新开具蓝字发票，再行抵扣的行为可能会给企业带来涉税风险。所以建议取得所属税务机关同意后，再行开具红字发票。
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