高新技术审计需提交的资料：
1、企业法人营业执照(副本复印件)。
2、税务登记证(国税、地税复印件)。
3、开业验资报告、评估报告(复印件)。
4、上年度审计报告(复印件)。
5、章程、合同(复印件)。
6、年度会计决算报表或中期报表(企业资产负债表、损益表、现金流量表及各种附表、财务情况说明书)。
7、会计帐簿及会计凭证。
8、会计科目余额表(1级至末级的期初、期末和累计发生额)。
9、存货及固定资产盘点表。
10、现金盘点表、银行对帐单及调节表(人民币、外币)。
11、长期投资(被投资单位营业执照、章程、会计报表)
12、借款、贷款、投资合同、协议书(复印件)。
13、纳税申报表及缴款书。
14、项目立项书。
15、专利及著作权等证书。
16、2007年高新产品(服务)合同。
17、《高新技术企业认定申请书》、《企业注册登记表》。
18、企业科技人员和研究开发人员的劳动合同。
19、技术创新活动证明材料，包括知识产权证书、独占许可协议、生产批文，新产品或新技术证明(查新)材料、产品质量检验报告，省级(含计划单列市)以上科技计划立项证明，以及其他相关证明材料。
20、业务约定书及管理当局说明书(盖章)。
另外：三年研发费用表，收入表，和自测表
高新技术企业认定专项审计，是指注册会计师接受拟向有关部门申请进行高新技术企业认定的申报企业委托，对其近三个会计年度(实际经营不满来三年的按实际经营年限)的研究开发费用结构明细表和近一个会计年度的高新技术产品(服务)收入明细表进行审计，并出具专项审计报告。
如果申报企业近三个会计年度的财务报表(含资产负债表、损益表、现金流量表，实际年限不足三年的按实际经营年限)未经会计师事务所审计，应同时委托进行财务报表审计。
此外有以下情自况的，都需要进行高新技术企业认定专项审计：
①凡拟向有关部门申请进行高新技术企业认定的企业，均需要进行高新技术企业认定专项审计。
②由于高新技术企业资格自颁发证书之日起有效期为三年，期满前三个月内企业应提出复审申请，不提出复审申请或复审不合格的，其高新技术企业资格到期自动失效。
所以凡拟向有关部门申请进行高新技术企业复审的企业，均需要进行高新技术企业认定专项审计。
主要审计的抄内容有两项：
1、近三年研究开发费用专项审计：对企业申报前三年研发费用的合理袭性审计，最终符合要百求的研发费用是否占企业营业的要求比例;
2、上年度高新技术产品(服务)度专项审计：对企业申报上一年的高新问技术产品(服务)收入的审计，最终符合要求的收入是否占企业总答收入的60%以上。
一、专项审计报告必须加盖骑缝章或每页加盖审讫章，同时专项审计报告的附表亦应加盖中介机构审讫章。
二、专项审计报告要求审计以下内容：
(一)近一个会计年度高新技术产品(服务)收入
1. 高新技术产品(服务)收入及其分项明细(见附表1);
2. 技术性收入及其分项明细(包括：技术转让收入、技术承包收入、技术服务收入、接受委托科研收入等)(见附表1);
3. 高新技术产品(服务)收入与技术性收入之和;
4. 高新技术产品(服务)收入与技术性收入之和占企业当年总收入的比例。
(二)近三个会计年度的研发费用分年度分项审计
1. 近三个会计年度的研发总费用、在中国境内发生的研究开发费用总额;
2. 近三个会计年度的研究开发费用总额占销售收入总额的比例;
3. 研究开发经费及其分年度分项明细(见附表2)。
三、专项审计报告要求对企业编制的附表1、附表2、附表3及编制说明发表专项审计意见。
四、中介机构应对企业高新技术产品(服务)收入及研发费用情况汇总表(见附表3)中企业填报的“销售收入”、“总收入”及其它指标的真实性和准确性予以重点复核。
注：专项审计报告总体要求按照《高新技术企业认定管理工作指引》，另可参照《高新技术企业认定专项审计指引》(会协[2008]83号)的有关规定执行。
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