发票作废后税金能退，企业的经办人员可以携带需要作废的发票、企业营业执照副本、公章、发票章以及由税务机关要求填写的表格等资料至税务机关前台办理税金的退税，或登录税务系统中填写作废信息并申请税金的退税。若企业发票作废后不办理税金退税手续，也可以与主管税务机关协商，将已预缴的增值税作为增值税纳税申报表和附加税纳税申报表中的抵减项目。
其中企业发票作废后可以退已经预缴的增值税、城市维护建设税、教育费附加和地方教育附加等项目。
