个税更正和个税作废的区别在于两者操作的流程不同：个税更正是在纳税人已经提交的申报表的基础上对当期个人所得税的数据进行修改；个税作废则是先将纳税人已经提交的申报表作废删除，然后重新填写所有信息并提交新的申报表。
对于个税作废，纳税人应当注意在完成作废的操作后必须在纳税期间内重新提交新的申报表，若纳税人未按时提交申报表的，则会被视为逾期申报的情况。而进行个税更正的纳税人一般无需担心逾期申报情况的发生，纳税人取消个税更正后，之前所申报的记录依然会登记在系统上。
